Została założona w 1978 roku. Ważny okres rozwoju artystycznego zespołu przypada na lata 1991-2001 kiedy to funkcję pierwszego dyrygenta sprawował František Vajnar (1930-2012). Od 2001 r. był on pierwszym dyrygentem honorowym orkiestry.
W latach 2001-2012 funkcję Pierwszego Dyrygenta pełnił Ondřej Kukal, następnie w latach 2012–2018 Andreas Sebastian Weiser, a od sezonu 2018/2019 do chwili obecnej funkcję tę pełni szwajcarski dyrygent Kaspar Zehnder.
Orkiestra występowała w ważnych salach koncertowych w całej Europie (Grosser Musikvereinssaal w Wiedniu, Gewandhaus w Lipsku, Victoria Hall w Genewie, Queen Elizabeth Hall w Antwerpii, Tonhalle w Düsseldorfie, Neue Flora w Hamburgu, KKL w Lucernie), występowała w Belgii, Francji, Włoszech, Niemczech, Holandii, Polsce, Austrii, Hiszpanii oraz w Murten w Szwajcarii.
Wybrane koncerty są transmitowane przez Telewizję Czeską, Telewizję Noe i Czeskie Radio. O jakości interpretacji osiągniętej przez orkiestrę świadczą nagrania płytowe zarówno dla firm krajowych, jak i zagranicznych czy dla Czeskiego Radia. Orkiestra bierze udział w najważniejszych festiwalach (Praska Wiosna, Międzynarodowy Festiwal Operowy w Litomyšlu Smetany, Międzynarodowy Festiwal Muzyczny Janáčkovy Hukvaldy, Międzynarodowy Festiwal Muzyczny Český Krumlov, Soundtrack i inne).
Od 2005 roku FHK wraz z Czeskim Radiem Vltava organizuje Music Forum Hradec Králové, wyjątkowy festiwal, na którym prezentowane są czeskie premiery kompozycji takich kompozytorów jak Schnittke, Penderecki, Henze, Kancheli, Gubajdulina, Corigliano, Tan Dun, Pärt i inni. Wszystkie koncerty Music Forum Hradec Králové są regularnie transmitowane na żywo przez Czeskie Radio Vltava.
Filharmonia w Hradcu Králové od dawna koncentruje się na adresowaniu swoich koncertów do młodzieży, a także na mieszaniu gatunków muzycznych i organizacji koncertów crossoverowych.
